Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms