Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4DQ08499 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms