Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DHX9Q08211 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms