Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms