Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms