Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX1Q04741 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms