Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms