Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERCC6Q03468 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERCC6Q03468 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms