Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms