Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms