Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms