Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms