Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms