Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms