Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms