Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRX1P78414 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms