Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVK-9P63128 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-9P63128 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms