Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms