Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms