Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO4P61968 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms