Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVS71-1P61550 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms