Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP25P60880 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms