Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms