Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms