Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms