Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNU13P55769 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms