Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LUMP51884 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LUMP51884 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LUMP51884 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LUMP51884 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms