Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAMP50895 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAMP50895 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAMP50895 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAMP50895 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms