Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK1EP49674 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms