Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms