Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FNTAP49354 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FNTAP49354 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms