Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLCP48506 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLCP48506 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLCP48506 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLCP48506 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLCP48506 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms