Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIP4K2AP48426 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIP4K2AP48426 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms