Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPOP42166 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPOP42166 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPOP42166 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPOP42166 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms