Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms