Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD1P33897 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD1P33897 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms