Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD34P28906 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD34P28906 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms