Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms