Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms