Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNB1P20700 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms