Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHCEP18577 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHCEP18577 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RHCEP18577 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms