Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTLA4P16410 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms