Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSP16219 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSP16219 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSP16219 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSP16219 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSP16219 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSP16219 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSP16219 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms