Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms