Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms