Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HKR1P10072 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HKR1P10072 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HKR1P10072 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms