Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC192P0DO97 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms