Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms