Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
ABCC9O60706 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ABCC9O60706 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC9O60706 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms