Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms